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然而从2005年开始，Alexa一直频繁调整计算方法，这一举措使得国内一系列网站遭遇了大清洗，大旗网、中搜网等都在2006年初的那次清洗中排名一落千丈。对此，Alexa声称，这是为了维护其数据的真实权威性所采取的打击作弊举措，今后还将继续监测网站的排名，还业界一个真实数据。这也直接促成了之后Alexa的多次清零行动，包括这次诸多明星网站的落马。
一次次的清零，一次次的国内知名网站栽跟头，有人直言：“中国网站就是Alexa作弊的重灾区”，国内网站的整体形象因此蒙上了阴影。姑且不论作没作弊，从大环境上，此举无疑加重了中国互联网的负担。
另外，融资是现在多数网站生存的最大期望，本来国内网站是希望依靠自己的高排名吸引风投的注意，从而为自己获得投资制造方便条件。但可以看到的是，曾经作为风险投资商资金流向的重要风向标的Alexa排名，如今越来越失去了它的权威性。一位风险投资从业人员称，数量众多虚假的Alexa排名，造成了风险投资商信息上的不准确，导致投资失误，大笔的资金打了水漂。不少风投公司已经开始只把其作为一个参考，而且着手研究更多的投资参考指标。
在这一批清零网站中，许多家都曾成功获得了风投，但许多互联网企业却是经营状况不良，一些仅靠风险投资过活的网站几近崩溃边缘。似乎，互联网的第二次冬天隐有重现之势。